看白癜风到中科白癜风医院导读
最新的流行病学调查表明，全球脑炎负担被严重低估，全球约有50万脑炎患者，预估死亡率大约为30%。自身免疫系统紊乱和感染是导致脑炎发生的两大主因，其中感染导致的脑炎占比全球脑炎患者的20-50%，但仍约有三分之一的脑炎患者不能明确病因。
脑炎病因不明，无法及时精准诊治仍是困扰临床的难题。新技术发展能克服临床脑炎诊治困难吗？脑炎诊疗的格局是否会因新技术而有所改变呢？Brown等最新发表在JournalofInfection的综述将带着这些问题开启一段探讨旅程。
原文标题：Encephalitisdiagnosisusingmetagenomics:applicationofnextgenerationsequencingforundiagnosedcases.
这样的mNGS，你了解吗？
现有对感染性脑炎的诊断高度依赖于临床医生的经验，医生需要根据患者的临床症状、流行病学数据、诊断指南等预先判断高度可疑的病原体，再进行“靶向钓鱼“(PCR或血清学实验)。这类常规检测方法一方面可能存在漏查漏检的问题，另一方面也难以鉴定罕见或新发病原体。基于宏基因组学的二代测序技术(mNGS)可以一次性检测诸如血液、脑脊液等临床样本中的DNA片段，进而在生物信息分析后将检出的DNA片段“归类划分”。mNGS具备“撒网捕鱼式”的方法学特性是在不依赖先验知识的前提下，即可将“致病菌、定植菌、罕见菌及未知菌”统统收入渔网，经由报告解读专家和临床专家共同协作最终确认病原体，明确诊断。
图1.RT-PCR与mNGS原理对比示意图
研究内容及结果
本文旨在对目前mNGS用于脑炎诊断领域的研究进行回顾、分析和总结，评估mNGS在脑炎诊断领域应用的可靠性及前景。研究者在数据库Medline和EMbase关键词搜索年1月至年4月发表的相关文献，10年间mNGS应用在脑炎诊断领域的文献呈快速增长趋势，共有25篇文章发表，涉及44个案例报导，美国、欧洲国家和中国等均有较大批量mNGS应用于脑炎的研究。其中，该44个案例中有16例mNGS检出病原菌经过PCR验证，检出的病原菌包括单纯疱疹病*、水痘带状疱疹病*、腮腺炎病*、EB病*、日本脑炎病*和结核杆菌等；其余28例mNGS检出病原菌可分为三大类：新发病原18例、罕见病原5例、未确认病原5例。
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KeyPoints
①分子检测技术(如PCR和mNGS)的检测结果，需要同时结合上实验室检查结果及患者临床症状，才能让临床医生做出利于患者的综合性判断。医院关鸿志教授年4月份发表4例mNGS用于临床脑膜炎的案例中，高达几万条的病原菌的检出序列数目和99.57%的基因组覆盖度更是达到明确诊断的强度。
②目前已发表文章多为案例报导，而方法学评估相关文章较少。根据已有的案例报导文章可见，mNGS阳性率为19%(3/16)、30%(3/10)、50%(8/16)不等；mNGS尤其适用于免疫缺陷患者的病原学诊断。
③mNGS检测流程需要设置完善的阳性质控和阴性质控，其中，确切的阳性结果可帮助临床明确诊断，确切的阴性结果可以协助临床排除感染。
④目前mNGS的交付周期为2~6天，未来极致交付时间将压缩至24小时，力求凸显mNGS全面、精准、快速的优势！
mNGS未来发展：挑战与机遇并存
▲全面覆盖几千种病原菌的方法学特性就意味着mNGS很难确认针对每种病原菌敏感性，但严格设置对照可以解决部分困难；
▲要求病原比对专用数据库尽可能的囊括所有病原菌，防止因未覆盖而导致的漏检；
▲测序数据中人源序列占比95%以上，相应导致测序时间延长和资源浪费。未来测序之前去掉人源宿主DNA或RNA，病原菌检测敏感性可以进一步提高。
图2.mNGS技术流程示意图
脑炎诊疗新格局，mNGS势在必行！
本综述系统回顾了mNGS用于脑炎诊断领域的研究进展。对于临床30-60%病因不明的脑炎，mNGS不仅可以协助脑炎病原学诊断，也用于其它症候群如呼吸道感染、血流感染等方面的病原学探查。综合全文，作者强烈推荐mNGS可以作为慢性和复发性脑炎的一线检查、急性脑炎的二线检查，尤其对于怀疑感染的免疫缺陷患者，更应该尽早使用mNGS溯觅寻因。
鉴于文章篇幅有限，本文未展开详细描述，如有兴趣，
